湖羊卵巢不同发育阶段的miRNA鉴定与分析

来源：畜牧兽医学报杂志2019年第7期北京时间：

作者：解领丽, 李嫒, 黄万龙, 张秀秀, 苗向阳

单位：中国农业科学院北京畜牧兽医研究所, 动物营养学国家重点实验室, 北京 100193

摘要：旨在分析不同发育阶段绵羊卵巢组织中miRNA的表达水平，了解miRNA表达及其调控机理。本研究采用转录组测序技术鉴定1和8月龄湖羊卵巢组织中的miRNA，运用生物信息学方法对差异表达的miRNA进行靶基因预测，并对靶基因进行GO和KEGG功能注释，筛选参与卵巢发育的miRNAs。结果显示，6个样品中检测到的已知miRNA个数分别为2 186、2 091、2 217、2 136、2 176、2 088，新miRNA的个数分别为613、567、668、640、662、450。筛选到701个差异表达novel miRNAs，38个差异表达已知miRNAs。对差异表达miRNAs的靶基因进行GO和KEGG分析，发现主要富集在血管内皮生长因子通路和卵巢类固醇生成等过程。对3个差异miRNAs进行qRT-PCR验证，与测序结果一致。oar-let-7b、oar-miR-29a、oar-miR-134-3p、oar-miR-541-3p等的靶基因富集在TGF-beta通路、卵巢卵泡生长等与卵巢发育相关的生物过程。oar-miR-148a、oar-miR-136的靶基因调控颗粒细胞增殖和类固醇生成，可能参与调控绵羊卵巢发育。

关键词：

基金资助：转基因生物新品种培育重大专项（2009ZX08008-004；2008ZX08008-003）；农业科技创新工程（ASTIP-IAS05）；中央级公益性科研院所基本科研业务费专项（Y2016JC22；Y2018PT68）