1株重组猪繁殖与呼吸综合征病毒的基因组特征

来源：畜牧兽医学报杂志2020年第12期北京时间：

作者：谭祥梅, 吴瑕, 陈鹏飞, 赵雄伟, 周书亭, 虞凌雪, 童武, 高飞, 姜一峰, 于海, 童光志, 周艳君

单位：1. 中国农业科学院上海兽医研究所, 上海 200241;2. 上海交通大学农业与生物学院, 上海 200240;3. 江苏省动物重要疫病与人兽共患病防控协同创新中心, 扬州 225009

摘要：猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）不断发生变异，其防控难度也逐渐增加。为了及时监测PRRSV在自然感染背景下的遗传进化特点，本研究从上海某发病猪场的临床样品中分离获得1株PRRSV毒株，命名为SHpd1/2018株，并对其生物学特性和基因组序列进行分析。结果表明，该毒株基因组全长为15 018 bp（不含poly A），不能被针对HP-PRRSV强毒HuN4株的Nsp2的单抗所识别，但其增殖特性与强毒HuN4株相似。序列分析表明，SHpd1/2018株与HP-PRRSV强毒株的相似性最高（与HuN4相似性为94.3%）。重组分析结果显示，SHpd1/2018株是以HP-PRRSV-like为主要亲本毒株，NADC30-like为次要亲本毒株的重组病毒，两个重组断点nt 2002和nt 3205均位于Nsp2基因的高变区。研究证实SHpd1/2018株是1株发生变异重组的PRRSV分离株，该毒株是上海某猪场保育猪发病的主要原因。

关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒,SHpd1/2018,生物学特性,基因重组分析

基金资助：国家重点研发计划项目（2017YFD0501104）；上海市科技兴农项目（2020-02-08-00-08-F01465）；国家自然科学基金（31702240）；国家生猪现代产业技术体系（CARS-35）