鸡传染性支气管炎病毒感染HD11细胞的转录组分析

来源：畜牧兽医学报杂志2023年第11期北京时间：

作者：陈璐, 常新宇, 沈嘉忱, 沈瑞廷, 赵振华, 侯晓林

单位：北京农学院动物科学技术学院, 北京 102206

摘要：旨在探究感染早期宿主细胞的天然免疫应答和抗病毒反应,本研究将鸡传染性支气管炎病毒(infectious bronchitis virus, IBV) Beaudette株感染鸡巨噬细胞HD11,2 h后提取细胞总RNA反转录成cDNA,采用Illumina进行转录组高通量测序。结果显示,感染组筛选出1 363个上调基因,653个下调基因。通过对差异表达基因GO和KEGG分析发现,IBV感染HD11细胞早期,差异表达基因大多与免疫反应、抗病毒作用有关,富集到的信号通路主要集中在细胞因子和细胞因子受体之间的相互作用、病毒蛋白与细胞因子或细胞因子受体之间的相互作用、TNF信号通路、MAPK信号通路等。随机挑选10个与免疫反应、抗病毒相关基因进行RT-qPCR验证,结果与转录组测序分析一致。本研究为进一步探究IBV致病机制和感染早期宿主细胞免疫反应奠定了基础。

关键词：鸡传染性支气管炎病毒,鸡巨噬细胞HD11,高通量测序,转录组

基金资助：国家自然科学基金(31372485)