基于转录组和蛋白质组分析筛选银黑狐毛色形成的关键基因

来源：畜牧兽医学报杂志2025年第9期北京时间：

作者：李佳鹏, 刘庆, 孙佳钰, 马泽芳, 崔凯

单位：青岛农业大学动物科技学院, 青岛 266109

摘要：旨在筛选影响银黑狐毛色形成的关键基因。在相同饲养条件下，本研究选取9月龄、健康且体重相近的雄性银黑狐和北美赤狐各4只，将其分为银黑狐组(YS)和北美赤狐组(CS)。分别采集两组狐的背中部皮肤样本进行转录组测序(RNA-Seq)和串联质量标签(TMT)标记的定量蛋白质组测序分析，筛选差异表达基因(DEGs)和差异表达蛋白(DEPs)并进行功能富集分析，鉴定与银黑狐毛色形成相关的候选基因。结果表明，与北美赤狐相比，在银黑狐皮肤中共鉴定到2 403个差异表达基因(DEGs)和203种差异表达蛋白质(DEPs)。功能富集分析显示，15个DEGs和6个DEPs通过黑色素合成、PI3K-Akt、cAMP、Wnt和MAPK信号通路参与调控黑色素生物合成。转录组与蛋白质组关联分析表明，TYRP1和NRAS等12个基因在mRNA和蛋白质表达水平上呈现一致的显著变化。蛋白互作网络分析进一步确认了TYRP1、NRAS、MLANA、LEF1、TYR、KITLG、EDNRB、GSK3β、AKT2和ERBB3基因为黑色素合成的关键基因。RT-qPCR和Western blot验证了测序结果的可靠性。本研究确定TYRP1和NRAS可能是影响银黑狐毛色表型的关键候选基因，为银黑狐毛色形成的分子调控机制及狐的分子育种提供了理论依据。

关键词：狐,毛色,转录组,蛋白质组,关键基因

基金资助：农业部财政项目：北美赤狐等3个品种性能测定和样品采集(19220703)；横向课题：改良型蓝狐综合培育技术的开发(6602419022)