一株牛源福氏志贺菌的分离鉴定及全基因组测序分析

来源：畜牧兽医学报杂志2026年第1期北京时间：

作者：张晶, 王亚平, 樊曦雯, 王真

单位：北京农学院动物科学技术学院，兽医学中兽医北京市重点实验室，北京 102206

摘要：近年来，牛易患腹泻病在牛场中进行传播，并有着较高的致死率，造成经济损失。本试验旨在对引起北京某牛场牛腹泻的福氏志贺菌进行分离鉴定，明确病原菌的血清型、耐药性和致病性等生物学特性及基因组特征。本研究采集腹泻牛粪便样本，进行细菌分离纯化、16S rRNA扩增子测序分析、毒力基因检测和分离株全基因组测序。结果显示，经细菌分离纯化、PCR鉴定发现一株福氏志贺菌Fc；基因组测序获得福氏志贺菌株Fc株全基因组大小为4.98 Mp，GC含量为50.76%；含有91个tRNA基因，7个23S rRNA，7个16S rRNA，8个5S rRNA，283个misc_RNA，97个碳水化合物活性酶基因；TVBD注释分析发现1 363个转运蛋白基因；CARD注释分析发现80个抗性基因；VFDB和PHI-base注释分析发现1 410个潜在的毒力因子相关基因及2 052个表型突变基因等。系统进化树分析发现福氏志贺菌与福氏志贺菌29903属于同一分支，进化关系最近。本研究完成了一株牛源福氏志贺菌的分离鉴定和全基因组测序分析，为志贺氏菌病的防控研究提供了理论依据。

关键词：福氏志贺菌,全基因组测序,耐药性,毒力