重金属复合污染农田土壤DNA的快速提取及其PCR-DGGE分析

来源：土壤学报杂志2004年第3期北京时间：

作者：滕应,骆永明,赵祥伟,李振高,宋静,吴龙华

单位：滕应，土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所), 南京 210008;中国科学院南京土壤研究所土壤与环境生物修复研究中心, 南京 210008；骆永明,ymluo@issas.ac.cn,骆永明，土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所), 南京 210008;中国科学院南京土壤研究所土壤与环境生物修复研究中心, 南京 210008；,赵祥伟，土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所), 南京 210008;中国科学院南京土壤研究所土壤与环境生物修复研究中心, 南京 210008；,李振高，土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所), 南京 210008;中国科学院南京土壤研究所土壤与环境生物修复研究中心, 南京 210008；,宋静，土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所), 南京 210008;中国科学院南京土壤研究所土壤与环境生物修复研究中心, 南京 210008；,吴龙华，土壤与农业可持续发展国家重点实验室(中国科学院南京土壤研究所), 南京 210008;中国科学院南京土壤研究所土壤与环境生物修复研究中心, 南京 210008；,

摘要：国内首次运用FastPrep®核酸快速提取系统提取了重金属复合污染农田土壤的DNA,并对其进行了聚合酶链反应—变性梯度凝胶电泳(PCR-DGGE)分析。结果表明,FastPrep®核酸提取仪与相应的FastDNA SPIN Kit for Soil试剂盒联用时,能有效地分离到纯度较高的重金属污染农田土壤的DNA。PCR-DGGE电泳图谱表明,PCR产物经DGGE检测后得到的电泳条带清晰且分离效果好,可以明显反映出重金属复合污染导致了农田土壤微生物在基因上的损伤,影响到农田土壤生态系统的细菌丰富度,改变了土壤环境的优势菌群,从而使农田土壤微生物群落结构多样性发生变化。可见,FastPrep®核酸提取系统同样适用于重金属污染农田土壤环境中微生物基因组DNA的快速分离和纯化,得到的DNA可直接用于PCR-DGGE分析。

关键词：重金属复合污染;农田土壤DNA;FastPrep®核酸提取系统;PCR-DGGE分析

基金资助：* 国家杰出青年基金项目(40125005);国家重点基础研究发展规划项目(2002CB410810、2002CB410809);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KZCX3-SW-429)资助