土壤微生物DNA木聚糖酶基因多样性的研究

来源：土壤学报杂志2006年第2期北京时间：

作者：张桂敏,庄永红,刘婷,马立新

单位：张桂敏，湖北大学生命科学学院, 武汉, 430062；,庄永红，湖北大学生命科学学院, 武汉, 430062；,刘婷，湖北大学生命科学学院, 武汉, 430062；,马立新，湖北大学生命科学学院, 武汉, 430062；malixing@hubu.edu.cn,

摘要：采用国产硅胶GF254(60型)代替进口Glass bead的改良方法抽提土壤微生物DNA,然后设计了一对扩增木聚糖酶基因片段的新简并引物,对抽提的土壤微生物DNA进行PCR扩增。扩增片段连接pMD18T载体,转化大肠杆菌,重组片段通过酶切进行RFLP分析后,测序分析得到10个木聚糖酶基因片段。对所得片段翻译的氨基酸序列进行BLAST分析表明有8个片段与来自放线菌的木聚糖酶具有较高的同源性,2个与假单胞菌的木聚糖酶具有较高的同源性。所得10个木聚糖酶片段的氨基酸序列同源性比较显示,第27个氨基酸均为天冬酰胺(N),暗示这些来自土壤微生物DNA的基因片段编码耐碱的木聚糖酶。通过构建系统进化树,发现扩增的木聚糖酶片段之间的相似性均在70%以上。

关键词：土壤微生物DNA;简并引物;木聚糖酶;基因多样性

基金资助：* 国家高技术863计划(2001AA214161,2002AA227011);湖北省自然科学基金项目(2005ABA201)资助