三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析

来源：土壤学报杂志2012年第2期北京时间：

作者：汪峰,曲浩丽,丁玉芳,孙波,曹慧,崔中利

单位：汪峰，南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室，中国科学院南京土壤研究所；,曲浩丽，南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室；,丁玉芳，南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室；,孙波，中国科学院南京土壤研究所；,曹慧，南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室；,崔中利，南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室；,

摘要：比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土（HL）、封丘潮土（FQ）和鹰潭红壤（YT）3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA，用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA，构建了3种土壤amoA基因文库，并对文库进行限制性长度多态性（RFLP）分析。HL、FQ和YT的amoA基因文库克隆数量分别为49、50和48个，相应的RFLP类型数为10、10和14个OTUs，其中有4个OTUs为三种土壤共有；YT中氨氧化细菌amoA基因多样性指数最高，FQ最低；HL和FQ群落的相似为70%，HL与YT的相似度为50%，而FQ和YT之间仅为42%，说明氨氧化细菌具有地理分布的规律；17个amoA基因序列可以被聚成6个cluster，分属Nitrosospira和Nitrosomonas两个属。三种农田土壤中均存在丰富的氨氧化细菌，表明氨氧化细菌在农田土壤氮素循环中具有重要作用。

关键词：氨氧化细菌;amoA基因;RFLP分析;农田土壤;微生物多样性

基金资助：国家自然科学基金项目（面上项目，重点项目，重大项目）