乳酸菌CRISPR-Cas系统同源性分析

来源：食品工业科技杂志2016年第11期北京时间：

作者：李婉, 张丹青, 王娜娜, 霍贵成

摘要：CRISPR-Cas系统为乳酸菌抵抗噬菌体等外源基因元件提供获得性免疫,利用生物信息学方法分析了CRISPR序列及cas基因在乳酸菌种间的同源性关系。利用生物信息学方法预测NCBI中已测序的部分乳酸菌所含CRISPRCas系统,并对重复序列和Cas蛋白序列进行系统发生学分析。结果显示,嗜热链球菌、德氏乳杆菌和瑞士乳杆菌标准菌株均含不同数目的 CRISPR-Cas系统,各类型的重复序列高度保守,Cas蛋白序列同源性较高。CRISPR-Cas系统的同源性与其亚型密切相关,而与菌种亲缘关系有较大差异,证明了CRISPR-Cas系统能够通过基因水平转移传播这一结论。

关键词：乳酸菌,clusteredregularlyinterspacedshortpalindromicrepeats（CRISPR）-Cas系统,同源性,重复序列,间隔序列,