亚洲棉全基因组中 NAC 类转录因子基因的鉴定与分析

来源：石河子大学学报·自然科学版杂志2015年第4期北京时间：

作者：赵灿, 刘任重, 柳展基, 李菲, 王立国, 马骏骏, 朱新霞

单位：（1 石河子大学生命科学学院农业生物技术重点实验室，石河子 832003；2 山东棉花研究中心，济南 250100）

摘要：为了开发棉花NAC基因资源，本文利用生物信息学方法在亚洲棉基因组中预测了138个NAC基因，根据其在染色体上的位置关系命名为GaNAC001-GaNAC138，所有GaNAC基因分布于亚洲棉13条染色体上。根据GaNAC蛋白的序列相似性及系统进化分析，将亚洲棉GaNAC蛋白分为11个亚家族，每个亚家族的GaNAC蛋白数目为4-25个。基因结构分析发现，大部分(63.7%)GaNAC基因含有2个内含子。比较亚洲棉与陆地棉、雷蒙德氏棉NAC蛋白的同源性，发现亚洲棉与雷蒙德氏棉NAC蛋白的匹配程度高于陆地棉，平均序列一致性分别为93.9%和81.2%，一些NAC基因(58/138)在棉属的进化过程中高度保守，一些(37/138)则变异程度较大，可能是生物体为了适应环境的变化产生了新的功能。本研究结果为亚洲棉及陆地棉NAC转录因子基因的后续深入研究提供了重要参考。

关键词：NAC 转录因子；棉花；亚洲棉；生物信息学

基金资助：国家棉花产业技术体系(CARS-18-10)，山东省农业生物资源创新利用研究项目，新疆生产建设兵团“新疆特色\r\n植物基因资源研究与利用创新团队”项目(2014CC005)，石河子大学育种专项（GXJS2014-YZ04）