《石河子大学学报·自然科学版杂志》发表论文赏析
作者:郑丽洁, 林军, 黄先忠
单位:(石河子大学生命科学学院,植物基因组学实验室,新疆 石河子 832003)
摘要:从小拟南芥,又名无苞芥(Olimarabidopsispumila,异种名Arabidopsispumila)幼苗叶片cDNA文库中获得1条与拟南芥烯醛双键还原酶基因AtDBR1(GenBank登录号为NP_197202.2)高度相似的EST序列,该序列包含1个1041bp的最大开放阅读框(ORF),推测编码346个氨基酸(GenBank登录号为KU845686)。利用RT-PCR技术从小拟南芥叶片的cDNA中克隆了该基因,命名为OpDBR。比对分析结果表明,该基因属于中链还原/脱氢酶(mediumchainreductase/dehydrogenases,MDR)超级家族,具有doublebondreductase-like保守蛋白结构域;该蛋白的二级结构包含106个α-螺旋和48个β-转角。系统进化树分析结果表明,OpDBR编码产物与预测的亚麻芥烯醛双键还原酶(GenBank登录号为XP_010492631.1)遗传关系最为接近,属于同一进化分支。实时荧光定量RT-PCR(qRT-PCR)结果显示,OpDBR在小拟南芥的不同组织中都有表达,茎中表达量最高,根中最低。其在200mmol/LNaCl、4℃、100μmol/LABA、20%PEG-6000处理下的表达结果分析显示,该基因可能在小拟南芥应对逆境胁迫时起着重要作用。
关键词:小拟南芥;无苞芥;DBR;抗逆;基因表达
基金资助:国家自然科学基金项目(U1303302)