《石河子大学学报·自然科学版杂志》发表论文赏析

新疆小拟南芥 NAC 转录因子 ApNAC055 的克隆及表达分析

来源:石河子大学学报·自然科学版杂志2017年第6期北京时间:

作者:林军, 张亮, 黄先忠

单位:(石河子大学生命科学学院特色植物基因组学实验室,新疆 石河子 832003)

摘要:本研究从新疆特色植物小拟南芥(Arabidopsispumila)盐胁迫转录组数据结果中,得到1条与拟南芥NAC转录因子ANAC055(GeneBank登录号为AEE75683.1)序列高度相似的Unigene。根据ORF序列设计引物,利用RT-PCR技术从小拟南芥叶片cDNA中克隆了该基因的codingsequence(CDS),命名为ApNAC055。生物信息分析结果表明,ApNAC055蛋白是1个无跨膜区域的亲水性蛋白,N端具有一段Noapicalmeristem(NAM)保守结构域;该蛋白二级结构包含73个α-螺旋和33个β-转角。系统进化分析结果表明,ApNAC055与芜菁NAC055进化关系较近,属于同一进化分支。实时荧光定量PCR(qRT-PCR)分析结果显示,ApNAC055在小拟南芥各组织中均有表达,在叶片和果荚中表达量均较高,尤其在果荚中;盐胁迫处理可明显诱导ApNAC055的表达。本研究表明,ApNAC055可能在小拟南芥耐盐中起重要作用。

关键词:We obtained a unigene from the transcriptome data of Arabidopsis pumila, a special plant in Xinjiang. Its amino acids sequence share high similarity with NAC transcription factor gene NAC055 of Arabidopsis thaliana (GeneBank accession number AEE75683

基金资助:国 家 自 然 科 学 基 金 项 目(U1303302、31060159)

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