《石河子大学学报·自然科学版杂志》发表论文赏析

阿尔茨海默病患者血液差异表达 micr oRNA 的生物信息学分析

来源:石河子大学学报·自然科学版杂志2017年第6期北京时间:

作者:董洪昌, 王娜, 黄瑾

单位:(石河子大学医学院生化教研室 / 新疆地方与民族高发病教育部重点实验室,新疆 石河子 832002)

摘要:筛选阿尔茨海默病相关血液microRNA作为诊断阿尔茨海默病疾病的分子标志物,探讨其在阿尔茨海默病中的作用及机制。在基因公共表达数据库中下载阿尔茨海默病病人血液及正常对照的表达谱数据,采用R语言筛选差异microRNA的方法,并通过在线工具string以及cytoscape构建其调控网络获得核心调控因素。结果显示,筛选到可能作为阿尔茨海默病疾病相关分子标志物的microRNA共9条。这些microRNA靶标基因涉及的功能主要有小G蛋白介导的信号转导、启动子转录调控、心脏小梁形态、活性氧依赖性反应、蛋白复合物的组装、细胞铁离子稳态以及血管生成等。主要参与调控的信号通路包括FOXO信号转导通路、Ras信号途径、过氧化物酶体信号转导途径、促性腺激素释放激素信号转导通路、雌激素信号转导通路、非小细胞肺癌、T细胞受体信号通路等。最终筛选到核心调控因子microRNA-148、microRNA-17以及microRNA-660。由此可知,microRNA-148、microRNA-17、microRNA-6603种microRNA可能作为主要调控因素参与了阿尔茨海默病病人血液中的调控机制,可作为诊断阿尔茨海默病的候选分子标志物。

关键词:阿 尔 茨 海 默 病;microRNA;生 物 信 息 学;分 子 标 志 物;AD 诊 断

基金资助:国家自然科学基金项目( 81771173) ,自 治 区 研 究 生 教 育 创 新 项 目( XJGRI2016036)

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