计算机辅助策略研究阿育魏实有效成分与诱导癌细胞凋亡机制的关系

来源：石河子大学学报·自然科学版杂志2018年第5期北京时间：

作者：罗丽 , 梁旭 , 张珂 , 王航宇 , 李国玉 , 吴霁蓂 , 黄健 , 王金辉 ,

单位：1 石河子大学药学院 / 新疆植物药资源利用教育部重点实验室，新疆 石河子 832002；2 哈尔滨医科大学药学院，黑龙江 哈尔滨 150081；3 沈阳药科大学中药学院，辽宁 沈阳 110016

摘要：目的本研究的目的是通过计算机辅助的方法研究阿育魏实（Trachyspermumammi(L.)Sprague)有效成分诱导癌细胞凋亡的机制。方法通过文献挖掘的方法确定阿育魏实候选小分子化合物，综合靶点预测、分子对接、网络药理学和分子动力学(MD)模拟等方法筛选阿育魏实化学成分中诱导癌细胞凋亡的活性成分并对其作用机制进行探讨。结果数据挖掘搜集到42个候选有效成分，随后运用靶点预测方法获得这些化合物的作用靶点，构建关键蛋白质的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)和miRNA-mRNA作用网络。然后，通过分子对接和分子动力学模拟进行验证，最终筛选出化合物1、10、11、12和ERBB2，IGF1R，ESR1，NQO1，MMP9之间能较好的相互作用。结论计算机辅助筛选分析表明，阿育魏实中化合物1，10，11，12可以靶向癌细胞中的蛋白ERBB2，IGF1R，ESR1，NQO1，MMP9，其可能揭示和探索阿育魏实用于治疗癌症复杂的分子机制。

关键词：阿育魏实；化学成分；靶蛋白；癌细胞；凋亡

基金资助：国家自然基金项目(81160543)；国家重大科技专项资助项目(2017ZX09305005)