MIRU 技术在石河子地区部分结核杆菌基因分型聚类分析中的初步应用

来源：石河子大学学报·自然科学版杂志2018年第5期北京时间：

作者：张少杰 , 陈华强 , 马超 , 芦孟欣 , 周洁 , 刘家辰 , 姬祥 , 陈旭 , 刘忠华 , 袁俐 , 曹旭东

单位：（1 石河子大学医学院 / 新疆地方与民族高发病教育部重点实验室，新疆 石河子 832003；2 石河子大学生命科学与技术学院，新疆石河子 832003；3 新疆生产建设兵团疾控中心检验科，新疆 乌鲁木齐 830002；4 上海市肺科医院，上海 200433）

摘要：目的采用结核杆菌散在分布重复单位（mycobacterialinterspersedrepetitiveunits，MIRU）分型技术，对石河子地区结核杆菌临床分离株进行基因分型及聚类分析，初步筛选可用于石河子地区结核杆菌临床分离株基因分型的MIRU位点。方法以本实验室保存的结核杆菌临床分离株基因组DNA为模板，采用PCR技术与核酸凝胶电泳技术，分别对7个MIRU位点进行检测，计算分辨指数，应用ntsys2.10e软件对菌株基因型进行聚类分析。结果石河子市33株临床分离株有22种基因型，均与结核杆菌标准株（H37Rv）不同；在石河子地区结核杆菌临床分离株的7个MIRU位点中，分辨率高的位点有1个(MIRU26)；中等有2个(MIRU10，MIRU16)；低的有3个(MIRU23，MIRU39，MIRU40)；有一个位点分辨率为0（MIRU27）；石河子地区分离株总HGI指数为：0.966。结论本实验选取的7个MIRU位点中有3个（MIRU26，MIRU10和MIRU16）可用于石河子地区结核杆菌临床分离株初步基因分型。

关键词：结核杆菌；基因分型；结核杆菌散在分布重复单位

基金资助：国家大学生创新创业训练计划项目（201710759022）；国家重点研发计划（2017YFD0500300）