基于RNA-Seq的子宫内膜癌灶与癌旁组织差异表达基因分析

来源：石河子大学学报·自然科学版杂志2022年第2期北京时间：

作者：杨冰琪, 王竞州, 庞槐, 袁成钢, 张君, 王翠喆

单位：石河子大学医学院/新疆地方病与民族高发病教育部重点实验室,新疆 石河子 832000

摘要：目的利用转录组测序(RNAsequencing,RNA-Seq)技术分析肥胖相关子宫内膜癌(EndometrialCancer,EC)癌灶及癌旁组织中的差异表达基因,寻找肥胖相关EC发生、发展的相关危险因素。方法对4例超重/肥胖伴EC患者的癌灶和癌旁组织进行转录组测序,筛选差异表达基因,并运用生物信息学技术对差异基因进行功能和通路富集分析。结果在EC癌灶及癌旁组织中共筛选出2451个差异表达基因,包含1697个上调基因,754个下调基因。GO功能富集分析表明:肥胖相关EC的发生发展与细胞间粘附调节、有丝分裂进程和错误蛋白折叠结合等一系列生物学进程密切相关。KEGG功能富集分析表明:肥胖相关EC的发生发展与病毒致癌、细胞周期、Hippo信号通路、细胞凋亡和p53信号通路等密切相关。结论Hippo信号通路、p53信号通路和NETs信号通路可能在肥胖相关EC发生发展过程中发挥重要作用。

关键词：子宫内膜癌,RNA-Seq,差异表达基因,通路功能富集

基金资助：国家自然科学基金项目(81900707);新疆生产建设兵团重点领域创新团队项目(2018CB002);石河子大学国际合作计划项目(GJHZ201703)