《上海理工大学学报杂志》发表论文赏析

全基因组关联分析显示基因ANXA8和C10orf11为影响肌少症的候选基因

来源:上海理工大学学报杂志2020年第3期北京时间:

作者:冉姝,何笑,蒋自璇,刘宝林,邓红文

单位:上海理工大学 医疗器械与食品学院,上海 200093,上海理工大学 医疗器械与食品学院,上海 200093,上海理工大学 医疗器械与食品学院,上海 200093,上海理工大学 医疗器械与食品学院,上海 200093,杜兰大学 公共健康医学院,美国

摘要:为了寻找与瘦体重(lean body mass,LBM)相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点及易感基因,在1 000个不相关的白人中采用Affymetix 500K芯片扫描了500 000个SNPs,并进行全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS),显著结果在1 625个中国人样本和2 283个欧洲白人样本中进行验证,并将验证结果与研究结果进行荟萃分析。研究发现SNPs rs7905603,rs9416083,rs4409772,rs2894310与LBM关联,其中rs7905603位于基因ANXA8,其他3个SNPs位于基因C10orf11。荟萃分析得到的合并p值分别为2.08×10-5,7.44×10-6,6.73×10-6,6.76×10-6。ANXA8和C10orf11基因是影响LBM变异的候选基因,这对肌少症的认识提供了新的理论依据。

关键词:肌少症;单核苷酸多态性;全基因组关联分析;瘦体重

基金资助:国家自然科学基金资助项目(31571291)

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