《计算物理杂志》发表论文赏析

生物分子模拟中的静电计算

来源:计算物理杂志2015年第2期北京时间:

作者:彭波, 李翰林, 卢本卓

摘要:在分子尺度上对生物系统的研究主要通过模拟生物分子间的相互作用来完成.在众多的分子间相互作用中,静电相互作用及其重要,对它的定量计算是了解生物分子的溶剂化效应、生物分子折叠和酶催化作用等的一个中心课题.本综述着重介绍用于计算溶剂化效应的泊松-玻尔兹曼模型,包括模型的理论基础、发展历程、数值求解方法、及在分子生物学研究中的应用等.同时,也介绍泊松-玻尔兹曼模型的一种近似模型,广义玻恩模型.

关键词:泊松-玻尔兹曼方程, 广义玻恩模型, 溶剂化效应, 边界元, 有限元

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