《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

不同物种TYR基因编码蛋白结构及功能的生物信息学分析

来源:江苏农业科学杂志2017年第第21期北京时间:

作者:郭敏; 李祥龙

单位:河北科技师范学院动物科技学院,河北秦皇岛 066004

摘要:利用生物信息学方法对13个物种TYR基因编码蛋白的理化性质,以及一级、二级、三级结构和亚细胞定位进行预测和分析,同时拟构建13个物种TYR基因的系统发育树。结果表明:TYR基因编码产物为不稳定蛋白(貉子除外),整条多肽链表现出亲水性。二级结构主要为α螺旋、β折叠,β转角区域分布少且散,均存在信号肽和跨膜区,可以判断TYR基因编码蛋白是定位于生物膜上的膜蛋白或分泌蛋白,主要在嘌呤和嘧啶、运输和结合、电压门控离子通道及转录中发挥作用。各物种TYR基因编码产物主要定位于内质网、高尔基体以及细胞质膜。除原鸡外,其他物种该蛋白均存在跨膜区,貉子有2个跨膜区域。各物种系统发育树与动物学进化观点基本一致。

关键词:物种;酪氨酸酶基因;毛色;蛋白质结构;生物信息学

基金资助:河北省高校创新团队领军人才培育计划(编号:LJRC004);河北省应用基础研究计划重点基础研究项目(编号:15962901D);河北省自然科学基金重点项目(编号:C2016407114)。

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