二穗短柄草Trihelix转录因子家族的基因组学分析

来源：江苏农业科学杂志2018年第第18期北京时间：

作者：胡风越; 刘廷武; 周曼丽; 周颖君; 周芮; 杨立明; 纪剑辉

单位：淮阴师范学院生命科学学院，江苏淮安 223300

摘要：Trihelix转录因子是一类与植物光应答反应、逆境胁迫应答和生长发育调控密切相关的转录调控蛋白家族，首先在植物中被发现。为深入了解Trihelix转录因子家族，便于植物Trihelix基因克隆并鉴定其功能，选用禾本科模式植物二穗短柄草，采用生物信息学相关方法，在二穗短柄草中鉴定出28个Trihelix转录因子家族基因，并依据蛋白保守域序列特点将其分为5个亚家族(Ⅰ～Ⅴ)，这28个Trihelix转录因子基因在染色体上均有分布且出现部分聚集现象。依据二穗短柄草、水稻、高粱和玉米中聚类分析及染色体区段复制分析所得结果，判断Trihelix基因家族在二穗短柄草、水稻、高粱和玉米中的进化关系，并推测Trihelix转录因子家族在物种演变过程中发生了基因的进化。

关键词：二穗短柄草;Trihelix;转录因子;生物信息学;物种演变

基金资助：国家自然科学基金(编号：41501262、31400169)；江苏省淮安市科技支撑项目(编号：HAN201604)；江苏省高等学校大学生实践创新训练计划(编号：201610323026Y)；江苏省自然科学基金(编号：BK20140455)；江苏省高等学校自然科学研究重大项目(编号：17KJA180002)；江苏高校品牌专业建设工程(编号：PPZY2015A018)；江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心；江苏省高校“青蓝工程”。