水稻Ds标记的矮秆突变体的分子鉴定

来源：江苏农业科学杂志2018年第第16期北京时间：

作者：郭妍妍; 赵丁丁; 孙丙耀

单位：苏州大学医学部基础医学与生物科学学院，江苏苏州 215123

摘要：通过已构建的水稻Ac/Ds突变体系，研究分析新型水稻功能基因，为水稻功能基因组学提供分子遗传方面的资源。从构建的水稻Ac/Ds突变体系中，筛选得到性状稳定的矮秆突变体(mutant type，MT)和正常株高回复体(revertant type，RT)。采用热不对称交错PCR(thermal asymmetric interlaced PCR，简称TAIL-PCR)技术，克隆Ds插入的侧翼序列，对该侧翼序列进行NCBI-Blast在线比对，寻找Ds插入基因；同时利用FGENESH、GeneMark.hmm、DNAMAN、SWISS-MODEL等软件分析Ds插入基因的结构和功能。发现Ds插入在水稻第3号染色体上的OSJNBa0054H04.28基因第4外显子上，此基因编码假拟氧化还原酶蛋白(putative oxidoreductase)，该蛋白含有1个保守的2OG-Fe(Ⅱ)加氧酶蛋白结构域。同时发现，RT中有Ds发生转座，并留下8个碱基的切离足迹，其转座机制属于“内切酶模式”。后续分析发现，该基因编码的假拟氧化还原酶蛋白可能在GA的合成过程中起重要作用。此基因是一个新的株高控制基因，可能通过编码假拟氧化还原酶蛋白影响GA的合成，从而对水稻株高的维持起到重要作用。

关键词：Ac/Ds'Ac/Ds;TAIL-PCR;假拟氧化还原酶蛋白;转座足迹;GA

基金资助：江苏省苏州市应用基础研究计划(农业部分)(编号：SYN201204)。