《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

乌拉尔图小麦PBF基因克隆及其序列分析

来源:江苏农业科学杂志2018年第第13期北京时间:

作者:胡喜贵; 吴晓军; 姜小苓; 王玉泉; 李淦; 胡铁柱; 茹振钢

单位:河南省现代生物育种协同创新中心/河南科技学院小麦研究中心,河南新乡 453003

摘要:醇溶蛋白盒结合因子(prolamin-box binding factor,PBF)是胚乳组织特异的基因表达调控因子,主要调控籽粒蛋白基因表达效率进而影响面粉的加工品质。本研究采用同源克隆方法从2份乌拉尔图小麦(Triticum urartu Tum.)中克隆得到2个PBF基因(GenBank登录号分别为MF547409和MF547410)。与已报道不同来源PBF基因比对分析发现,乌拉尔图小麦PBF存在丰富变异位点,高达45个单核苷酸多态性位点(SNPs)。其推导的PBF蛋白具有典型DOF结构特征,存在22个氨基酸变异位点,尤其第22位A→S和第23位G→A变异形成特有酪氨酸激酶Ⅱ磷酸化位点(CK2-phospho-site)。该结果表明乌拉尓图小麦PBF基因具有较高遗传多样性,也暗示了氨基酸变异位点可能对其PBF蛋白的调控功能产生影响。同时,聚类分析显示乌拉尓图小麦与普通小麦的PBF蛋白聚在1个亚组,进一步证实了二者亲缘关系较近。

关键词:乌拉尔图小麦;PBF基因'PBF基因;序列分析;单核苷酸多态性位点(SNPs)

基金资助:国家重点研发计划(编号:2017YFD0100705);河南省科技攻关项目(编号:162102110060);河南省新乡市科技重大专项(编号:ZD17005);河南科技学院引进高层次人才科研启动项目(编号:201010613001)。

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