海南五指山猪TLR4基因克隆及生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2019年第第08期北京时间：

作者：黄丽丽; 张艳; 刘海隆; 林哲敏; 谭树义

单位：1.海南省农业科学院畜牧兽医研究所，海南海口 571100； 2.海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室，海南海口 571100

摘要：为获得海南五指山猪TLR4基因序列并分析其分子结构特征，以GenBank中猪的TLR4基因序列为参考序列，采用PCR技术对该基因组序列进行克隆、测序及相关生物信息学分析。结果显示，获得的五指山猪TLR4基因DNA序列长10 435 bp，其中编码区全长2 526 bp，共编码841个氨基酸；与GenBank中发布的普通猪的TLR4基因序列相比，存在38处突变(其中有2处突变位于编码区)；与普通猪、牛、绵羊、犬、马、猕猴、人、黑猩猩、小鼠和鸡的同源性分别为99.9%、80.7%、79.9%、74.8%、74.7%、73.1%、73%、72.7%、62.5%、43.4%；五指山猪TLR4编码的蛋白属于分泌性蛋白和跨膜蛋白，具有亲水性，有8个糖基化修饰位点、17个丝氨酸(ser)、7个苏氨酸(Thr)及8个酪氨酸(TYR)磷酸化位点；氨基酸系统进化树分析表明，不同物种TLR4基因在进化过程中具有较高的保守性。该结果为进一步深入研究TLR4基因的功能奠定基础。

关键词：五指山猪;TLR4基因'TLR4基因;克隆;生物信息学分析

基金资助：国家自然科学基金(编号：31560696)；海南省农业科学院农业科技创新专项(编号：CXZX201504)；海南省自然科学基金(编号：20153080)。