基于SNP和SSR对甜玉米种质遗传多样性的评价

来源：江苏农业科学杂志2019年第第07期北京时间：

作者：么大轩; 张彬; 刘松涛; Zenda Tinashe; 段会军

单位：河北农业大学/华北作物种质资源研究与利用教育部重点实验室，河北保定 071001

摘要：利用单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，简称SNP)与简单重复序列(simple sequence repeat，简称SSR)2种分子标记对23份甜玉米自交系进行遗传多样性评价。结果表明，6对针对su1基因的SNP引物分别在 7 790、8 210、10 550 bp位点处检测到22、17、23个自交系发生突变。23份甜玉米自交系在相似系数为0.55处被划分为4个SNP类群；用19对针对玉米10条染色体的SSR引物共检测出83个多态性位点，平均每对引物检测到的多态性位点数为44个，在相似系数为0.55处被划分为5个SSP类群。2种分子标记在类群划分中既存在一定的相关性，也存在一定的差异。用SNP、SSR法检测的平均遗传相似系数分别为0.64、0.71，表明23份甜玉米自交系存在比较丰富的遗传变异，种质资源较为丰富。

关键词：甜玉米;分子标记;SNP;SSR;聚类分析

基金资助：国家重点研发计划(编号：C2017YFD0300901)；河北省现代农业产业技术体系玉米产业创新团队建设项目(编号：HBCT2018020207)。