基于16S和COⅠ基因探讨岩扇贝在
扇贝科中的分类地位

来源：江苏农业科学杂志2019年第第07期北京时间：

作者：曹善茂; 朱丽洁; 聂鸿涛; 印明昊; 刘钢; 邹建威; 王尧

单位：1.大连海洋大学/辽宁省海洋生物资源恢复与生境修复重点实验室，辽宁大连 116023；2.大连海洋大学水产与生命学院/辽宁省贝类良种繁育工程技术研究中心，辽宁大连 116023； 3.辽宁省大连市海洋与渔业局，辽宁大连 116023

摘要：采用PCR扩增和序列测定等技术，对岩扇贝(Crassadoma gigantea)线粒体DNA 16S rRNA和COⅠ基因片段进行初步研究，得到16S rRNA基因片段的大小在613.0~634.0 bp之间，A、T(U)、G、C的平均含量分别为26.5%、29.7%、24.5%、19.3%；COⅠ基因片段的大小为660 bp，碱基A、T、G、C的平均含量分别为17.2%、40.3%、27.2%、15.3%。16S基因在岩扇贝中偏好使用GUU、UUG、AUU、ACG、UAU、CAA、GAG、UUU、UCU、GAU、GGU、GAG、AGG和GGA等25个密码子。COⅠ系统进化树表明，与岩扇贝亲缘关系最近的是柿孔扇贝(Azumapecten farreri)，其次是冰岛扇贝(Chlamys islandica)。16S系统进化树亲缘关系由近到远依次是北美扇贝(Patinopecten caurinus)、虾夷扇贝(Mizuhopecten yessoensis)、Chlamys islandica。

关键词：岩扇贝;COⅠ基因'COⅠ基因;16S rRNA;密码子偏好性;系统进化树分析

基金资助：辽宁省海洋与渔业厅项目(编号：201214)； 辽宁省大连市海洋与渔业局项目 (编号：2012011)。