基于SLAF-seq技术的苹果SNP位点开发及遗传多样性分析

来源：江苏农业科学杂志2023年第第8期北京时间：

作者：刘万达;杨光;焦奎宝;王昆;王天鹤;王禹;吴立仁

单位：1.中国农业科学院果树研究所/农业农村部园艺作物种质资源利用重点实验室，辽宁兴城 125100；2.黑龙江省农业科学院园艺分院，黑龙江哈尔滨 150040； 3.黑龙江省农业科学院乡村振兴科技研究所，黑龙江哈尔滨 150028

摘要：为了解黑龙江苹果种质资源的遗传关系，利用特异性位点扩增片段测序技术(SLAF-seq)对在黑龙江地区收集的31份苹果种质资源进行SNP 位点开发和遗传多样性分析。最终获得了107.52 Mb读长数据，不同材料的SNP标记数目在 309 012~540 030 间，样品测序质量值平均Q30为93.78%，平均GC含量为40.90%。共开发获得 1 072 115 个SLAF标签，其中，多态性SLAF标签有275 389 个。通过序列分析，共得群体SNP位点121 352 个，基于开发SNP分子标记，结果表明，31 份苹果种质资源分为3 个亚群，特异性的苹果SNP位点开发和研究可为苹果种质资源鉴定和遗传多样性分析提供理论基础。

关键词：苹果;SLAF-seq技术;SNP;遗传多样性分析