甘蓝型油菜响应干旱胁迫的转录组分析

来源：江苏农业科学杂志2023年第第5期北京时间：

作者：张蕾;阮羽萱;潘娇;陈敏;刘博宇;阮颖;黄勇

单位：湖南农业大学生物科学技术学院/湖南省作物表观遗传与发育重点实验室，湖南长沙 410128

摘要：甘蓝型油菜(Brassica napus L.)是我国主要油料作物之一，为国家粮油安全提供了重要保障。干旱严重限制了油菜种植规模扩大、产量与品质提升。为挖掘甘蓝型油菜抗旱的关键基因，阐明油菜耐旱机制，本研究以甘蓝型油菜湘油15为对象，通过实验室模拟干旱处理后的叶片为材料进行转录组测序(RNA-Seq)、生物信息分析并 qRT-PCR 验证。发现转录组样本平均Clean baseas约为9.6 G，且各样品碱基百分比(Q30)大于93.21%，比对到参考基因组上的Reads在89％以上。干旱处理4 h后，湘油15出现了440个差异表达基因(DEGs)，其中148个基因上调，292个基因下调。随机选取10个基因(上调与下调各5个)进行qRT-PCR验证，其中9个基因的qRT-PCR结果与 RNA-Seq结果相符，仅1个基因表达趋势相反，相似度可达90％，证实转录组测序结果的可靠性。结果表明甘蓝型油菜湘油15主要通过光合作用、碳代谢和渗透调节等途径调节抗旱能力，为进一步阐明油菜耐旱机制奠定了基础。

关键词：甘蓝型油菜;干旱胁迫;转录组分析;差异表达基因