基于转录组分析的紫花苜蓿组成型抗蓟马性研究

来源：江苏农业科学杂志2023年第第5期北京时间：

作者：爽爽;代蕊;陈崎;刘慧洁;姜晓红;特木尔布和;谭瑶;张志强

单位：1.内蒙古农业大学草原与资源环境学院 草地资源教育部重点实验室/国家林业草原北方抗旱耐寒草品种育繁工程技术研究中心/农业农村部饲草栽培、加工与高效利用重点实验室/内蒙古自治区草地管理与利用重点实验室，内蒙古呼和浩特 010021；2.内蒙古农业大学草原昆虫研究中心，内蒙古呼和浩特 010021

摘要：为了探究紫花苜蓿组成型抗蓟马转录调控机制，以自主培育的抗蓟马苜蓿品种草原4号为研究对象，以感蓟马苜蓿品种草原2号为对照，采用RNA-seq技术进行转录组测序分析。试验共获得82.34 Gb clean data，组装得到77 837个unigenes，139 949个转录本，平均序列长度为830.17 bp；共有47 573个unigenes被注释到六大数据库中。与草原2号相比，草原4号共检测到差异基因2 388个，其中上调基因1 361个，下调基因1 027个。KEGG对相关差异基因的功能注释表明，上调基因主要注释到能量代谢、碳水化合物代谢等代谢过程以及遗传信息处理相关途径，下调基因主要注释到遗传信息处理、细胞过程和环境适应相关途径。qRT-PCR验证结果发现所选的8个基因在2个品种中的相对表达量同RNA-Seq测的结果一致，说明本试验中转录组的结果可靠。结果可为揭示苜蓿组成型抗蓟马机理奠定基础，进而为抗蓟马新品种培育及蓟马防治提供理论支撑。

关键词：苜蓿;抗蓟马;转录组;RNA-seq