《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

群结腐霉细胞壁降解酶的活性检测及基因表达分析

来源:江苏农业科学杂志2023年第第4期北京时间:

作者:陈一帆; 薛太强; 陈思桥; 张金凤; 周冬梅; 魏利辉

单位:1.江苏大学环境与安全工程学院,江苏镇江 212013; 2.江苏省农业科学院植物保护研究所,江苏南京 210014

摘要:群结腐霉(Pythium myriotylum)是一种死体营养型病原菌,可侵染生姜引起茎基腐病,造成生姜产量损失,严重危害该产业发展。群结腐霉含有大量植物细胞壁降解酶(plant cell wall-degrading enzymes,PCWDEs),然而PCWDEs在群结腐霉侵染生姜过程中的功能和特性却鲜有报道。运用生物信息学手段预测群结腐霉细胞壁降解酶的种类和数量,并以生姜粉末和葡萄糖为碳源,比较菌丝生长的情况,利用转录组分析比较PCWDEs基因在不同碳源条件下的表达差异情况,同时对培养液中主要PCWDEs进行酶活检测。转录组数据显示,与葡萄糖培养基相比,生长在生姜粉末培养基上的群结腐霉中12个PCWDEs编码基因显著上调表达,利用CAZymes网站预测PCWDEs的底物主要为淀粉和纤维素;酶活检测发现,其中α-葡萄糖苷酶和β-葡萄糖苷酶活性较高,分别降解淀粉和纤维素。结果表明,群结腐霉在生姜粉末上生长过程中的PCWDEs以淀粉降解酶和纤维素降解酶为主。

关键词:群结腐霉;植物细胞壁降解酶;转录组;酶活

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