抗生素溶杆菌13-6次生代谢物Myxin对水稻条斑病菌活体转录组的影响

来源：江苏农业科学杂志2024年第第24期北京时间：

作者：孟涵;魏方俊;王博文;袁加升;彭梦林;刘学瑞;姬广海

单位：云南农业大学省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室，云南昆明 650201

摘要：近年来，水稻细菌性条斑病已成为影响我国水稻产量的重要病害之一。探究抗生素溶杆菌13-6次生代谢物对水稻条斑病菌的影响，明确抗生素溶杆菌13-6次生代谢物对水稻细菌性条斑病的防病机制，对于实际生产具有重要意义。在水稻感病品种日本晴(4叶期)上接种条斑病菌YM15，48 h后用抗生素溶杆菌13-6次生代谢物(480 μg/mL)处理，然后进行活体转录组测序分析、生物信息分析并进行qRT-PCR验证。结果表明，经抗生素溶杆菌13-6次生代谢物处理后，将处理组和对照组与参考基因组基因进行对比，共得到203个差异显著基因，上调基因125个，下调基因78个。随机挑选10个基因(上调6个，下调4个)进行qRT-PCR验证，qRT-PCR结果与RNA-Seq结果一致，证实转录组测序结果可靠。在GO功能富集中，差异基因主要集中在相应刺激和生物调控等过程；在KEGG功能富集中，差异基因主要集中在双组分系统等代谢通路。本研究发现，抗生素溶杆菌13-6次生代谢物可显著影响病原菌中与致病性相关的基因，如鞭毛合成相关基因和趋化性相关基因。此外，抗生素溶杆菌13-6次生代谢物还可影响KEGG代谢通路中与鞭毛组装相关的基因、双组分系统以及氨基酸代谢过程相关基因表达，为进一步阐明Myxin对水稻细菌性条斑病的作用靶点奠定了基础。

关键词：水稻;细菌性条斑病;抗生素溶杆菌;次生代谢物;基因表达差异;活体转录组