石榴TIFY基因家族的全基因组鉴定与表达分析

来源：江苏农业科学杂志2024年第第19期北京时间：

作者：李晓静;鲁海菊;岳亮亮

单位：1.红河学院生物科学与农学学院，云南蒙自 661100； 2.西南林业大学高原湿地中心，云南昆明 650224

摘要：TIFY转录因子在植物生长发育和逆境响应中起重要作用。以石榴基因组数据为基础，利用生物信息学方法，开展TIFY转录因子的鉴定，并进行蛋白理化性质、系统进化关系、保守基序、基因结构、表达模式、顺式作用元件分析。结果表明，在石榴基因组中共鉴定到16个TIFY基因，可分为ZML、JAZ、TIFY、PPD这4个亚家族。PgTIFY基因结构存在明显差异，其中ZML亚家族基因结构最复杂。表达分析结果表明，PgTIFY2、PgTIFY3、PgTIFY7、PgTIFY10、PgTIFY12在叶片中高表达；PgTIFY1、PgTIFY4、PgTIFY5、PgTIFY8、PgTIFY13、PgTIFY16在根中高表达；PgTIFY15、PgTIFY11在花中高表达。JAZ亚家族基因在盐胁迫和ABA处理组织中差异表达。16个PgTIFY基因启动子均含有低温、干旱、缺氧等胁迫响应元件和茉莉酸甲酯、ABA、生长素、JA相关激素响应元件类型。推测PgTIFY基因家族可能在石榴果实发育、逆境响应、激素信号调控等方面发挥重要作用。

关键词：石榴;TIFY基因家族;表达分析;顺式作用元件