基于全基因组重测序技术对平菇白色变异菌株的鉴定及遗传变异研究

来源：江苏农业科学杂志2024年第第18期北京时间：

作者：夏会楠;郝刘斌;田雨;李海康;王春霞;郑素月

单位：河北工程大学园林与生态工程学院，河北邯郸 056038

摘要：以生产上收集的一个平菇白色变异菌株(Po50)、黑色出发菌株(Po51)和一个白色生产菌株(Po9)为材料，采用拮抗、酯酶同工酶和全基因组重测序方法对3个菌株进行鉴定。拮抗和酯酶同工酶结果表明，白色变异菌株和黑色出发菌株之间无明显拮抗和酶谱差异，与生产平菇白色菌株差异较大；进一步通过全基因组重测序技术鉴定结果表明，3个菌株鉴定出大量的SNP(单核苷酸多态性位点)、InDel(插入缺失位点)、SV(结构变异位点)。平菇白色变异菌株Po50检测到SNP、InDel突变总数为1 504 391个，生产菌株Po9检测到SNP、InDel突变总数为1 371 818个，黑色出发菌株Po51检测到SNP、InDel突变总数为1 501 877个，通过生物信息手段分析白色变异菌株黑色出发菌株以及对照菌株Po9基因组间的结构差异，获得遗传变异图谱，可以对变异菌株进行快速精准鉴定。

关键词：平菇;变异菌株;全基因组重测序技术;酯酶同工酶