基于转录组分析枇杷响应干旱胁迫的分子机制

来源：江苏农业科学杂志2024年第第17期北京时间：

作者：赵双;尤伟忠;汪溢;郄红丽

单位：1.苏州农业职业技术学院，江苏苏州 215008； 2.江苏省太湖常绿果树技术推广中心，江苏苏州 215107； 3.江苏省农业种质资源保护与利用平台，江苏南京 210014

摘要：为了探索枇杷对于干旱胁迫响应和耐受性的分子机制，鉴定可用于培育抗旱枇杷新品种的关键基因，为枇杷抗旱机制提供理论依据，以白玉枇杷为试验材料，通过转录组测序(RNA-Seq)筛选响应干旱胁迫的差异表达基因。以正常供水为对照，进行短期干旱胁迫处理，RNA-Seq筛选差异表达基因(DEG)，并对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集分析。结果表明，RNA-Seq共鉴定出3 270个DEG，其中上调1 810个，下调1 460个。GO富集分析表明，一些胁迫响应基因在干旱处理后显著上调。KEGG富集分析表明，植物MAPK信号通路、植物激素信号转导、类胡萝卜素生物合成等相关DEG在响应胁迫中发挥关键作用。对DEG深入分析发现，干旱胁迫后，抗氧化酶基因、脱落酸(ABA)生物合成基因NCED、ABA信号通路基因显著上调。此外，通过分析转录因子，发现枇杷主要通过调控bHLH、bZIP、AP2/ERF、GRAS、HD-Zip、MYB、MYB_related、NAC、WRKY这9个家族转录因子的表达来响应干旱。

关键词：枇杷;干旱胁迫;转录组分析;差异基因表达