马冈鹅和泰州鹅粪便微生物区系分析及潜在功能预测

来源：江苏农业科学杂志2024年第第9期北京时间：

作者：吴云飞;涂远璐;马曦;闫俊书;奚雨萌

单位：1.石河子大学动物科技学院，新疆石河子832000； 2.江苏省农业科学院畜牧研究所/农业农村部种养结合重点实验室，江苏南京210014； 3.中国农业大学动物科学技术学院，北京100193

摘要：为分析马冈鹅和泰州鹅种鹅粪便微生物组成差异，探究粪便微生物区系对宿主生理功能调节的潜在影响。试验选取体重相似、日龄相仿、饲养环境相同的健康种鹅17羽(泰州鹅8羽+马冈鹅9羽)，利用16S rDNA高通量测序技术分析种鹅粪便菌群多样性、种属差异及其对宿主生理功能的潜在影响。结果表明，在多样性分析上，2个品种粪便微生物菌群Chao1指数、Simpson指数和Shannon指数品种间无显著差异，主坐标分析聚类不明显。分析粪便菌群结构组成发现，在门水平上，厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门是种鹅粪便中的优势菌群；在属水平上，罗氏菌属、拟杆菌属、普雷沃氏菌属_9、乳酸杆菌属等是优势菌群种属。同时，泰州鹅粪便中厚壁菌门细菌CAG:822、苯基杆菌属和漫游菌属细菌平均丰度显著高于马冈鹅；但固氮螺菌属Blvii28_wastewater-sludge_group、Ezakiella、默多克菌属、假谷氨酸菌属和斯内菌属平均丰度显著低于马冈鹅(P<0.05)。KEGG功能预测提示，马冈鹅与泰州鹅粪便差异菌群可能影响宿主碳水化合物代谢、糖基化合物合成、能量代谢等生理过程。综上，在相同饲养条件下，马冈鹅和泰州鹅种鹅粪便微生物区系总体上受其遗传背景影响较小，但也在菌群组成上表现出一定差异，可能影响宿主环境适应、碳水化合物代谢、氨基酸代谢等生理功能的调节。

关键词：鹅;品种;粪便微生物;16S rDNA;菌群结构;功能预测