滇龙胆C2H2基因家族鉴定及响应茉莉酸甲酯诱导表达分析

来源：江苏农业科学杂志2024年第第9期北京时间：

作者：谷云霞;王梦琦;张婷;单李铭;刘小莉

单位：云南中医药大学中药学院，云南昆明 650500

摘要：滇龙胆(Gentiana rigescens)是龙胆药材的基源植物之一，C2H2锌指蛋白是锌指蛋白家族中的一个大家族，其成员在1年生滇龙胆转录中最为丰富，本研究拟在对滇龙胆转录组中C2H2基因家族进行鉴定并分析响应茉莉酸甲酯(MeJA)诱导表达模式，为滇龙胆C2H2转录因子功能研究提供参考。基于滇龙胆转录组数据，利用NCBI、MAFFT、MEME、STRING等在线网站及TBtools 软件对其基因信息、进化关系、表达模式等进行分析。结果表明，从滇龙胆转录组中共鉴定出31 个含有C2H2保守结构域的序列(GrC2H2 1~GrC2H2 31)，编码的氨基酸数量在53(GrC2H2 14)～604个(GrC2H2 31)之间，等电点介于4.23～9.92之间，且31 个家族成员都定位在细胞核中，其家族分为10 个亚家族，GrC2H2 5、GrC2H2 6、GrC2H2 8、GrC2H2 11、GrC2H2 17、GrC2H2 18、GrC2H2 19、GrC2H2 22、GrC2H2 23 和GrC2H2 31 共10个转录因子为滇龙胆C2H2转录因子的正调控因子。2种浓度MeJA诱导后C2H2表达模式显示，MeJA浓度越高，GrC2H2基因表达量越高。本研究首次鉴定了滇龙胆C2H2基因家族并分析了其响应MeJA表达模式，可为后续深入研究C2H2基因家族功能及滇龙胆优质品种的选育提供理论参考。

关键词：滇龙胆;生物信息学;C2H2 转录因子;基因表达;茉莉酸甲酯诱导