茶树GATA基因家族的全基因组鉴定及表达分析

来源：江苏农业科学杂志2024年第第9期北京时间：

作者：青亚林;侯炳豪;张宇航;曾珊珊;高婷;叶乃兴

单位：福建农林大学园艺学院，福建福州 350002

摘要：植物转录因子GATA与靶基因启动子上的WGATAR序列结合，改变下游靶基因的转录，从而调控植物的生长发育。对茶树GATA转录因子的生物学信息特征进行鉴定与分析，为后续茶树栽培育种等相关研究提供理论依据。利用生物信息学方法及实时荧光定量PCR技术，对茶树GATA家族基因进行全基因组鉴定与表达分析。结果表明，(1)鉴定出的35个茶树GATA基因分布于13条染色体上，亚细胞定位预测主要在细胞核上。(2)系统进化分析将茶树GATA基因家族成员分为4个亚族。(3)茶树GATA启动子顺式作用元件分析显示，茶树GATA启动子上有许多光响应、激素信号响应与环境胁迫响应相关的元件。(4)组织特异性分析显示，GATA基因在茶树不同组织中的表达模式有显著差异，多数基因在芽上具有较高的表达。(5)实时荧光定量PCR分析结果显示，在不同处理下，茶树GATA家族基因表达量总体呈下调趋势，其中CsGATA1表达量下调最显著。CsGATA对逆境胁迫响应敏感，说明CsGATA可能参与调控茶树不同生长发育过程，其中CsGATA1可能参与茶树生长发育及逆境胁迫响应的调控。

关键词：茶树;GATA基因家族'GATA基因家族;生物信息学;基因表达;全基因组鉴定