桑属植物叶绿体基因组特征比较及系统发育分析

来源：江苏农业科学杂志2024年第第7期北京时间：

作者：张浩蓉;秃玉翔;李启少;曹正英;赵文植;沈伟祥;孙正海

单位：西南林业大学园林园艺学院/国家林业和草原局西南风景园林工程技术研究中心，云南昆明 650224

摘要：探究桑属叶绿体基因组特征及该属物种的系统发育进化关系。收集8种桑属植物叶绿体基因序列，基于最大似然法重建桑属植物系统发育关系，并运用生物信息学手段进行叶绿体基因组特征分析。桑树叶绿体基因组结构为典型的四段式结构，大单拷贝区长89 952 bp，小单拷贝区长 20 149 bp，2个反向重复区长25 751 bp。共检测到 661个SSR位点，包含480个单核苷酸位点、57个二核苷酸位点、25个三核苷酸位点、82个四核苷酸位点、16个五核苷酸位点、1个六核苷酸位点，碱基组成以A/T碱基类型为主，平均GC含量为36.2%。变异度在前3位的间隔区依次是 psbl-trnS(GCU)-trnG(UCC)、 rps4-trnT(UGU)-trnL(UAA)、rp132-trnL(UAG)。桑属树种的叶绿体基因组相对较大，且序列稳定，变异主要发生在 LSC 区。相较于基因编码区，桑属植物的基因非编码区更容易积累突变。桑与蒙桑具有较近的亲缘关系，其次是华桑与吉隆桑。

关键词：桑属;叶绿体基因组;特征;系统发育