gga-miR-26a的组织特异性表达及其靶基因的预测分析

来源：江苏农业科学杂志2024年第第5期北京时间：

作者：李瑞瑞;张子晓;赵振华;韩威;向海;王钱保;黄正洋;李春苗;宗毅;黄华云

单位：1.江苏省家禽科学研究所，江苏扬州225125； 2.佛山科学技术学院广东省动物分子设计与精准育种重点实验室，广东佛山528225； 3.河北科技师范大学，河北秦皇岛066600

摘要：为初步阐明gga-miR-26a在鸡脂肪沉积中的作用，以矮小品系S3系(DW)和隐性白羽鸡(RR)为试验素材，采用实时荧光定量PCR法检测gga-miR-26a在2个品种不同生长发育时期肝脏、腹脂及腿肌组织，腹脂和肌内脂肪细胞增殖期和分化期的表达变化，并利用生物信息学的方法，对gga-miR-26a靶基因进行预测和分析。结果表明，gga-miR-26a在S3系鸡(DW)和隐性白羽鸡(RR)16 W时肝脏组织中的表达存在显著的品种差异，S3系鸡在5个发育阶段表达均高于隐性白羽鸡；腹脂组织中，gga-miR-26a在0 W时存在极显著的品种差异(P＜0.01)且显著高于其他周龄；gga-miR-26a在腿肌组织中的表达无显著的品种差异(P>0.05)；在脂肪细胞中，gga-miR-26a在分化4 d的表达显著高于增殖期(P<0.05)。利用TargetScan、miRDB、miRmap等3个软件对gga-miR-26a靶基因进行预测，共预测到163个交集靶基因；GO及KEGG分析提示gga-miR-26a可能通过靶向调节PTEN、ULK2和PRKCD的表达，进而调控鸡的脂肪沉积。综上所述，gga-miR-26a在2个品种鸡脂肪相关组织及脂肪细胞中均有表达，且具有显著的品种差异；gga-miR-26a参与了鸡的脂肪沉积过程，PTEN、ULK2和PRKCD可能是gga-miR-26a调控脂肪沉积的预测靶基因。

关键词：gga-miR-26a;鸡;表达特性;靶基因