水稻核糖体失活蛋白家族基因OsRIP8的生物信息学与功能分析

来源：江苏农业科学杂志2024年第第4期北京时间：

作者：徐娅;黄佑岗;李树杏

单位：贵州省农业科学院水稻研究所，贵州贵阳 550006

摘要：核糖体失活蛋白(RIPs)是一种能使真核细胞核糖体功能被抑制的毒蛋白。OsRIP8是属于该家族的一个功能未知基因。为研究该基因生物学功能，通过数据库对其进行生物信息学分析，利用qRT-PCR验证其表达模式，同时构建OsRIP8-RNAi 干涉载体并利用农杆菌转化水稻，采用PCR技术鉴定出转基因阳性植株，分析阳性植株的表达和农艺性状，初步揭示该基因的功能。结果表明，水稻OsRIP8蛋白为不稳定亲水蛋白，不含信号肽及完整的跨膜结构域，蛋白结构以α螺旋为主；在OsRIP8基因启动子区域存在着与植物生长发育、生物与非生物胁迫以及植物激素响应有关的元件；OsRIP8基因的共表达基因富集到多种大分子的生物合成与蛋白代谢等途径；qRT-PCR分析结果表明，OsRIP8基因在发育的小穗及抽穗前1 d的花药中优先表达；RNAi干涉后OsRIP8基因的表达下调造成植株花粉育性和结实率显著降低。暗示该基因对水稻小穗的发育具有重要作用，可能参与调控花粉发育过程。

关键词：水稻;核糖体失活蛋白;生物信息学分析;功能分析;基因表达