基于线粒体Cytb基因的江淮下游6个湖泊翘嘴鲌群体遗传多样性分析

来源：江苏农业科学杂志2024年第第3期北京时间：

作者：李大命;杨子萍;刘燕山;唐晟凯;谷先坤;殷稼雯

单位：1.江苏省淡水水产研究所/江苏省内陆水域渔业资源重点实验室，江苏南京 210017； 2.南京师范大学海洋科学与工程学院，江苏南京 210023

摘要：以线粒体Cytb基因作为分子标记对长江、淮河下游6个湖泊翘嘴鲌群体共262尾个体的遗传多样性、遗传分化及历史动态进行分析。结果显示，翘嘴鲌Cytb基因序列全长为1 141 bp，碱基A+T的含量(55.9%)高于G+C含量(44.1%)。262条Cytb基因序列检出42个变异位点，定义46个单倍型，总群体单倍型和核苷酸多样性分别为0916±0.010和0.00 256±0.00 008；6个群体的单倍型多样性为(0.798±0.059)~(0.927±0.019)，核苷酸多样性为(0002 04±0.000 27)~(0.002 85±0.000 18)，表明翘嘴鲌遗传多样性属于高Hd和低Pi模式。基于单倍型构建的系统发育树和进化网络图显示，6个群体的单倍型未形成明显的地理格局。分子方差分析(AMOVA)显示，遗传变异主要来自于群体内部(91.64%)，群体间遗传分化系数(Fst)为0.083 62(P<0.01)；6个群体间的Fst为 -0.004 27~0.155 29，其中，长江群体和淮河群体间均具有显著中度或高度遗传分化(P<0.05)。中性检验结果显示，Tajimas D和Fus Fs均为负值(P<0.05)，核苷酸不配对分布曲线呈现单峰型，表明翘嘴鲌群体在历史上经历过显著的种群扩张。整体来看，江淮下游湖泊的翘嘴鲌野生种质资源遗传多样性较低，长江水系群体和淮河水系群体间有显著的遗传分化，应采取措施恢复翘嘴鲌资源量及提高其遗传多样性，并将长江流域和淮河流域湖泊群体划分为不同的管理单元进行保护。

关键词：翘嘴鲌;Cytb基因'Cytb基因;遗传多样性;遗传分化;种群历史动态