辣椒CaNRAMP基因家族的鉴定与表达分析
来源：江苏农业科学杂志2019年第第10期北京时间：
作者：胡灿; 刘峰; 王运生
单位：1.湖南农业大学，湖南长沙 410128； 2.湖南省农业科学院蔬菜研究所，湖南长沙 410128
摘要：为了初步研究辣椒(Capsicum annuum L.)NRAMP家族基因在重金属镉胁迫下的表达情况，通过生物信息学方法从辣椒基因组中鉴定出NRAMP基因，并对这些基因的序列结构、系统进化树、表达谱等进行系统分析。结果表明，辣椒中含有5个具有典型NRAMP结构域的基因，根据其在染色体上的位置，分别将其命名为CaNRAMP1~CaNRAMP5，根据系统进化分析，将辣椒的NRAMP基因分为2类，Ⅰ类包含2个基因(CaNRAMP1、CaNRAMP3)，分别含有10、12个内含子，Ⅱ类包含3个基因(CaNRAMP2、CaNRAMP4、CaNRAMP5)，均含有3个内含子。基于基因组织表达模式的分析结果表明，CaNRAMP1在不同组织中均未检测到其表达；CaNRAMP5的表达集中在花器官，其余CaNRAMP基因均有不同的表达模式；通过逆转录定量PCR(qRT-PCR)分析发现，辣椒苗期中的叶片经过镉处理后，CaNRAMP3基因呈明显上调的趋势，参与镉胁迫反应的正向调控，其他基因则不参与镉胁迫反应的调控。研究结果为进一步分析辣椒NRAMP基因家族的功能奠定了基础。
关键词：辣椒;NRAMP基因家族'NRAMP基因家族;生物信息学;基因表达
基金资助：国家自然科学基金(编号：31470105)；南方蔬菜优质高效生产关键技术研究与示范项目(编号：2014BAD05B04)。
