43种植物CaM1基因密码子使用特征及遗传差异分析

来源：江苏农业科学杂志2019年第第05期北京时间：

作者：李晨辉; 赵子捷; 陈文烨; 焦义然; 杨帆; 刘永伟; 董福双; 杜进民; 周硕

单位：1.河北菲尼斯生物技术有限公司，河北石家庄 050035；2.山西农业大学信息学院，山西太谷 030800；3.河北科技大学生物科学与工程学院，河北石家庄 050000； 4.河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心，河北石家庄 050051

摘要：为深入了解不同类植物CaM1基因(calmodulin 1，简称CaM1)在抵抗逆境进化过程所形成的密码子的使用特征和遗传差异。运用CodonW、BioEdit和MEGA软件对43种植物序列进行分析，并构建系统发育树。结果表明，CaM1基因对密码子的使用具有极强的偏好性，CUC、AUC、UCU、CCA、ACU、UGA为其最优密码子，禾本目植物更偏好使用G/C碱基。G、C碱基含量和位置是引起CaM1基因密码子偏性的主要原因。遗传距离分析表明，山柑目与白花菜目之间的亲缘关系最近，豆目和无患子目间的亲缘关系次之，与聚类分析结果相符。

关键词：CaM1'CaM1;密码子偏性;遗传距离;亲缘关系

基金资助：国家自然科学基金青年科学基金(编号：31600216)；河北省自然科学基金青年基金(编号：C2017301066)；河北省现代农业创新工程项目(编号：2019-4-8)。