罗氏沼虾转录组免疫相关SNP的挖掘与分析

来源：江苏农业科学杂志2019年第第04期北京时间：

作者：唐修阳; 王传聪; 项杰; 欧江涛; 王资生

单位：盐城工学院海洋与生物工程学院，江苏盐城 224051

摘要：为了挖掘罗氏沼虾免疫相关单核苷酸多态性(SNP)，采用第二代高通量测序技术，对罗氏沼虾的肝胰腺进行转录组深度测序分析。结果发现SNP位点37 589个，其中转换25 188个，颠换12 401个。再对SNP所在的基因进行GO(gene ontology)分类和KOG注释，分别筛选到2 451个有GO注释和2 458个有KOG注释的SNP，并重点对4个重要免疫通路的145个免疫相关基因，筛选出129个SNP位点。相关研究结果将为进一步系统挖掘免疫相关SNP的分子遗传标记奠定基础，为罗氏沼虾疾病防控和选育抗病新品种提供科学参考。

关键词：罗氏沼虾;转录组;SNP;高通量测序技术;免疫;抗病

基金资助：国家自然科学基金面上项目(编号：31570176、31872601)；国家自然科学基金青年科学基金(编号：31000072)。