养殖大鲵肠道细菌多样性

来源：江苏农业科学杂志2019年第第01期北京时间：

作者：兰阿峰; 郭素芬; 彭浩; 刘栋; 邓百万

单位：1.陕西理工大学生物科学与工程学院，陕西汉中 723001； 2.陕西省食药用菌工程技术研究中心，陕西汉中 723001；3.陕西理工大学大鲵研究所，陕西汉中 723001

摘要：纯培养分离大鲵肠道细菌，选用细菌通用引物进行16S rRNA扩增，测序后提交序列并分析；免培养方法采用试剂盒提取肠道内容物总DNA，选用细菌通用引物对总DNA进行16S rRNA扩增，构建克隆文库，对阳性克隆进行PCR-RFLP分析，用Hae Ⅲ内切酶进行片段插入性验证并进行测序，构建系统发育树。纯培养获得103个菌株，分属于16个不同的可操作分类单元(operational taxonomic units，OTUs)，系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)。其中，变形菌门(占克隆总数 87.63%)为最优势类群。免培养结果将随机挑取的105个阳性克隆归为15个OTUs，系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)4个门。其中，变形菌门(占克隆总数的71.43%)为最优势类群。养殖大鲵肠道细菌多样性丰富，具有进一步开发研究的价值。

关键词：养殖大鲵;肠道细菌;纯培养;免培养;多样性

基金资助：陕西省教育厅项目(编号：15JK1123)；陕西理工大学人才引进启动项目(编号：SLGQD-8)。