《江苏农业科学杂志》发表论文赏析

谷子NCED基因家族鉴定及其干旱胁迫响应
表达模式分析

来源:江苏农业科学杂志2019年第第01期北京时间:

作者:程鸿燕; 郭昱; 马芳芳; 王玉文; 禾璐; 韩渊怀

单位:1.山西农业大学农学院,山西太谷 030801; 2.山西农业大学生物工程研究所,山西太谷 030801;3.山西省农业科学院谷子研究所,山西长治 046000; 4.山西省农业科学院玉米研究所,山西忻州 034000

摘要:基于转录组数据分析并结合谷子基因组数据库鉴定出10个候选NCED基因,对它们的结构特点、理化性质、启动子元件功能等进行分析,并以抗旱(GG)和干旱敏感谷子品种(JF16)为材料,对PEG胁迫前后差异基因的表达特点进行分析。结果表明,谷子中编码NCED家族基因启动子中含较多与抗旱胁迫相关的功能元件;经PEG胁迫处理后,Seita.2G035400在GG和JF16中表达量均上调,但上调幅度有所差异。该研究结果进一步加强了对植物NCED基因家族的了解,也为后续进行谷子抗旱机制和抗旱分子育种提供了理论借鉴依据。

关键词:谷子;NCED家族基因;干旱胁迫;表达;生物信息学

基金资助:国家自然科学基金(编号:31401396);山西省青年科技研究基金(编号:201601D021125);山西省重点研发项目(编号:201703D211008);山西省主要农作物种质创新与分子育种重点科技创新平台项目(编号:201605D151002);山西农业大学校基金(编号:2013YJ04、2014022、2014YZ2-5)。

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