基于高通量测序技术的红枣黑斑病病原菌分离与鉴定

来源：江苏农业科学杂志2020年第第24期北京时间：

作者：刘晓勤; 张锐利

单位：1.塔里木大学生命科学学院，新疆阿拉尔 843300；2.塔里木盆地生物资源保护利用兵团重点实验室-省部共建国家重点实验室培育基地，新疆阿拉尔 843300

摘要：通过探究造成南疆红枣黑斑病的主要病原菌类别，为该病的靶向防治奠定理论基础。采用高通量测序技术和传统分离鉴定相结合的方法分别对南疆的喀什、和田、阿克苏等3个地区患病红枣黑斑部位进行病原菌鉴定。结果表明，从27个样品中获得91 137个高质量序列，其中相对丰度最高的菌门是子囊菌门，相对丰度最高的菌属是链格孢属(Alternaria)，3个地区链格孢属的相对丰度分别是99.98%、98.15%、99.92%，其他菌属的相对丰度均在0.95%以下。通过对患病果实样品和代表菌株进行组织分离、形态学观察、分子生物学分析和病理学接种试验，明确造成南疆红枣黑斑病的主要病原菌是链格孢(Alternaria alternata)，占85.6%。

关键词：南疆地区;红枣黑斑病;高通量测序;病原鉴定