基于分子对接从天然产物中虚拟筛选HPPD先导化合物

来源：江苏农业科学杂志2020年第第24期北京时间：

作者：刘学贵; 周静瑶; 黄明远; 岳丹丹; 吕梦超; 孙羽俅; 高品一; 李丹琦

单位：1.沈阳化工大学功能分子研究所，辽宁沈阳 110142； 2.沈阳化工大学制药与生物工程学院，辽宁沈阳110142；3.沈阳科技学院，辽宁沈阳 110000； 4.硼镁资源开发与精细化工技术国家地方联合工程实验室，辽宁沈阳 110142；5.辽宁省绿色功能分子设计与开发重点实验室，辽宁沈阳 110142

摘要：对羟基苯丙酮酸双加氧酶(p-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase，简称HPPD)作为一种化学除草剂的重要靶标酶已引起越来越多的关注。基于分子对接技术，以HPPD靶蛋白为受体，通过研究配体与受体的结合模式，以商品化除草剂吡草酮为阳性对照，对课题组从天然植物透骨草和紫花苜蓿中分离得到的41个化合物进行虚拟筛选，根据对接得分以及分析结合模式得出10个对靶标活性位点具有较好潜在抑制活性的化合物，同时，分数高于吡草酮的化合物4′-氧-(赤型-β-愈创木脂甘油基)醚、4′-氧-(苏型-β-愈创木脂甘油基)醚和(3R)-7-羟基-2′，4′，5′-三甲氧基-异黄烷-7-氧-β-D-葡萄糖苷不仅可以完全嵌入HPPD活性囊中，且存在与吡草酮相似的氨基酸残基作用以及氢键和π-π堆积等作用。上述结果对设计新型高效的HPPD抑制除草剂具有重要的指导意义，也为使用计算技术开发新型HPPD抑制剂除草剂提供了重要参考。

关键词：对羟基苯基丙酮酸双加氧酶;除草剂;分子对接;天然产物;先导化合物;筛选;吡草酮