黑水虻抗菌肽的克隆及其生物信息学分析

来源：江苏农业科学杂志2020年第第24期北京时间：

作者：胡珊珊; 陈开莉; 陈红贤; 邬开鑫; 尤忠毓

单位：嘉兴学院生物与化学工程学院，浙江嘉兴 314001

摘要：为了开发新型昆虫抗菌肽资源，以黑水虻幼虫为研究对象，采用RT-PCR技术从黑水虻幼虫总RNA中扩增到一个新型抗菌肽基因DLP-5，并利用在线生物软件和工具分析了抗菌肽DLP-5的生物信息学特征。结果表明，DLP-5由40个氨基酸残基组成，分子量为4 226.83 u，等电点为7.87，具有两亲性特征，其中N端为疏水性，C端为亲水性，具有3个磷酸化位点，无糖基化位点、信号肽序列和跨膜区。DLP-5的三级结构包含1个N端的loop区、1个α螺旋和1对反向平行β折叠，构成了防御素类抗菌肽典型的“环-螺旋-折叠”结构，说明DLP-5是一个新型的防御素类抗菌肽，可通过与微生物膜相互作用发挥其抗菌活性。

关键词：昆虫抗菌肽;黑水虻;基因克隆;生物信息学