《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:俎天娇;乔潇;张小芳;张锴;乔亚科;李桂兰
单位:1.河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北昌黎 066600; 2.河北科技师范学院物理系,河北秦皇岛 066004
摘要:为获取干旱胁迫状态下的bHLH家族相关基因,以30 d苗龄的野生大豆为试验材料,浇灌20% PEG-6000模拟干旱胁迫,分别在干旱处理后0、6、12、24、48 h取样提取叶片RNA并进行转录组测序。以基因本体论数据库(GO)、京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)、NCRI蛋白数据库(NR)注释的结果为基础,以bHLH转录因子为关键词进行筛选,再综合转录因子分析中提供的相关数据,共获得177条相关序列,包括64个bHLH家族成员。通过蛋白网络互作分析确定了4个干旱相关基因。为进一步研究野生大豆干旱胁迫下bHLH家族抗旱基因提供了理论基础。
关键词:野生大豆;转录组;干旱胁迫;bHLH;显著差异表达基因;转录因子