《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:凤舞剑;陶佩琳;白耀博
单位:徐州生物工程职业技术学院/徐州市现代农业生物技术重点实验室,江苏徐州 221006
摘要:稻瘟病是影响水稻产量和品质的重要病害,挖掘稻瘟病菌的潜在防治靶标对于水稻稻瘟病害的绿色防治具有重要意义。为了鉴定稻瘟病菌的潜在杀菌剂靶标,利用生物信息学和结构生物学比较分析了天然杀菌剂褪黑素、商用杀菌剂稻瘟灵和天然杀菌剂衍生物Mt-23处理稻瘟病菌的基因表达差异,同时利用AlphaFold2和分子对接对潜在靶标进行了分子模拟和预测。结果表明,共鉴定到399个基因在3种杀菌剂处理后均差异显著;对差异基因的功能富集中发现3种杀菌剂均能靶向稻瘟病菌的核心功能,分别包括3-氧代酰基-[酰基载体蛋白]合成酶活性、细胞壁、葡萄糖苷酶活性、脂质代谢、磷脂结合、多糖代谢和膜等功能;同时筛选到8个参与稻瘟病菌细胞的能量代谢和细胞呼吸相关基因为潜在的杀菌剂靶标;利用分子对接发现3种杀菌剂均能靶向结合在MGG_16149蛋白保守的结合口袋。该研究结果鉴定的稻瘟病菌核心靶标,将有助于促进稻瘟病菌绿色杀菌剂的开发和应用。
关键词:稻瘟病菌;杀菌剂;分子对接;AlphaFold2;防治靶标;转录组